12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00050 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00050  amino acid transporter, putative  100 
 
 
801 aa  1622    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03550  conserved hypothetical protein  32.31 
 
 
525 aa  207  7e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368686  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79777  predicted protein  32.87 
 
 
598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405101  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60861  predicted protein  27.25 
 
 
544 aa  151  5e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.78945  normal  0.726976 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08854  amino acid transporter (Eurofung)  30.79 
 
 
451 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9355  predicted protein  31.45 
 
 
393 aa  118  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0272446  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45915  AAAP family transporter: amino acid  28.98 
 
 
474 aa  99.8  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81023  predicted protein  23.41 
 
 
670 aa  58.2  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07777  amino acid transporter (Eurofung)  23.96 
 
 
580 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.14577  normal  0.468629 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87014  predicted protein  24.83 
 
 
621 aa  48.5  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.728691  normal  0.601954 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  22.3 
 
 
511 aa  45.4  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  24.73 
 
 
449 aa  45.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>