28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45260 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  100 
 
 
594 aa  1200    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  41.62 
 
 
647 aa  382  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  31.3 
 
 
555 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  31.09 
 
 
424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  31.96 
 
 
511 aa  168  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10338  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09300)  25.95 
 
 
448 aa  97.4  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749689  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  22.57 
 
 
472 aa  96.3  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49391  predicted protein  27.75 
 
 
538 aa  95.5  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02460  transporter, putative  25.72 
 
 
482 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  21.88 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40731  predicted protein  22.25 
 
 
584 aa  76.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247124  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30899  AAAP family transporter: amino acid  20.82 
 
 
529 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50146  predicted protein  23.88 
 
 
589 aa  66.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42888  predicted protein  20.53 
 
 
564 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0590475  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50072  predicted protein  23.05 
 
 
505 aa  63.9  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.955215  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47781  predicted protein  24.05 
 
 
437 aa  60.5  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.938739  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49278  predicted protein  25.18 
 
 
618 aa  54.3  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50071  predicted protein  31.4 
 
 
501 aa  53.9  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0530284  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04477  amino acid transporter (Eurofung)  23.02 
 
 
739 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87014  predicted protein  20.54 
 
 
621 aa  51.2  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.728691  normal  0.601954 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03550  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 
525 aa  51.2  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368686  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40517  predicted protein  23.7 
 
 
501 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299005  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08854  amino acid transporter (Eurofung)  25.22 
 
 
451 aa  48.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07777  amino acid transporter (Eurofung)  18.99 
 
 
580 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.14577  normal  0.468629 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45915  AAAP family transporter: amino acid  21.17 
 
 
474 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06100  conserved hypothetical protein  21.43 
 
 
819 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0680473  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49568  predicted protein  20.14 
 
 
605 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110101  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9355  predicted protein  19.93 
 
 
393 aa  43.9  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0272446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>