17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49391 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49391  predicted protein  100 
 
 
538 aa  1088    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  27.64 
 
 
555 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  27.75 
 
 
594 aa  106  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  27.79 
 
 
647 aa  84.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  25.44 
 
 
511 aa  84.3  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02460  transporter, putative  24.39 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  22.55 
 
 
424 aa  61.6  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  22.15 
 
 
472 aa  57  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40731  predicted protein  22.47 
 
 
584 aa  57  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247124  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49278  predicted protein  24.92 
 
 
618 aa  51.2  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10338  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09300)  24 
 
 
448 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749689  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42888  predicted protein  23.41 
 
 
564 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0590475  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  21.71 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30899  AAAP family transporter: amino acid  28.23 
 
 
529 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9355  predicted protein  21.85 
 
 
393 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0272446  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45969  predicted protein  26.15 
 
 
509 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79777  predicted protein  22.83 
 
 
598 aa  43.5  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>