25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49278 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49278  predicted protein  100 
 
 
618 aa  1273    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42888  predicted protein  27.67 
 
 
564 aa  128  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0590475  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  27.13 
 
 
555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  24.78 
 
 
511 aa  92.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02460  transporter, putative  25.57 
 
 
482 aa  89.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  21.94 
 
 
449 aa  87  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  26.4 
 
 
647 aa  83.6  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  22.98 
 
 
472 aa  80.9  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  23.81 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10338  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09300)  22.37 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749689  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40731  predicted protein  21.96 
 
 
584 aa  68.2  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247124  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  25.08 
 
 
594 aa  67.8  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04477  amino acid transporter (Eurofung)  23.6 
 
 
739 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50072  predicted protein  23.03 
 
 
505 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.955215  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28839  AAAP family transporter: amino acid  24.15 
 
 
744 aa  60.8  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.046591  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50146  predicted protein  24.47 
 
 
589 aa  58.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87014  predicted protein  20.45 
 
 
621 aa  57.4  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.728691  normal  0.601954 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07777  amino acid transporter (Eurofung)  21.15 
 
 
580 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.14577  normal  0.468629 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45915  AAAP family transporter: amino acid  24.4 
 
 
474 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49391  predicted protein  24.92 
 
 
538 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30899  AAAP family transporter: amino acid  22.57 
 
 
529 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03550  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 
525 aa  47.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368686  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06100  conserved hypothetical protein  19.4 
 
 
819 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0680473  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50071  predicted protein  23.29 
 
 
501 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0530284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15700  putative amino acid permease  28.06 
 
 
418 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.328993  hitchhiker  0.00000000000353656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>