15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42888 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42888  predicted protein  100 
 
 		 564 aa  1148    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0590475  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49278  predicted protein  27.49 
 
 		 618 aa  107  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  25.07 
 
 		 472 aa  93.2  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  23.12 
 
 		 555 aa  80.5  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02460  transporter, putative  25.43 
 
 		 482 aa  80.1  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  21.1 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  20.37 
 
 		 511 aa  71.6  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  20.53 
 
 		 594 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48219  predicted protein  23.58 
 
 		 480 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289088  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40731  predicted protein  20.57 
 
 		 584 aa  60.8  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247124  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10338  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09300)  24.49 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749689  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  18.38 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  20.29 
 
 		 647 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45915  AAAP family transporter: amino acid  32.14 
 
 		 474 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30899  AAAP family transporter: amino acid  21.93 
 
 		 529 aa  47  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>