18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48219 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48219  predicted protein  100 
 
 
480 aa  971    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289088  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50146  predicted protein  38.29 
 
 
589 aa  279  8e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48637  predicted protein  41.45 
 
 
551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47781  predicted protein  39.84 
 
 
437 aa  274  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.938739  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50071  predicted protein  40.94 
 
 
501 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0530284  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50072  predicted protein  38.42 
 
 
505 aa  270  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.955215  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49985  predicted protein  40.44 
 
 
505 aa  269  8.999999999999999e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45969  predicted protein  29.03 
 
 
509 aa  186  6e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43280  predicted protein  25.91 
 
 
528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0677337  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  23.66 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  24.22 
 
 
555 aa  73.6  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  20.99 
 
 
511 aa  64.3  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42888  predicted protein  23.58 
 
 
564 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0590475  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02460  transporter, putative  23.33 
 
 
482 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  22.84 
 
 
647 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  21.97 
 
 
449 aa  48.1  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10338  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09300)  23.9 
 
 
448 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749689  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  21.6 
 
 
594 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>