18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48637 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48637  predicted protein  100 
 
 
551 aa  1102    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50072  predicted protein  42.16 
 
 
505 aa  296  9e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.955215  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50146  predicted protein  40.88 
 
 
589 aa  283  6.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47781  predicted protein  40.18 
 
 
437 aa  276  5e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.938739  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50071  predicted protein  42 
 
 
501 aa  276  7e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0530284  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48219  predicted protein  41.55 
 
 
480 aa  274  4.0000000000000004e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289088  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49985  predicted protein  39.6 
 
 
505 aa  267  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45969  predicted protein  28.05 
 
 
509 aa  183  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43280  predicted protein  28.43 
 
 
528 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0677337  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  26.5 
 
 
555 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  24.38 
 
 
449 aa  60.5  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  23.65 
 
 
647 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  23.74 
 
 
472 aa  54.7  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  22.49 
 
 
424 aa  53.9  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02460  transporter, putative  25 
 
 
482 aa  53.5  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10338  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09300)  25.71 
 
 
448 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749689  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42888  predicted protein  24.87 
 
 
564 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0590475  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  23.74 
 
 
511 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>