21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50071 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_50071  predicted protein  100 
 
 
501 aa  987    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0530284  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50146  predicted protein  69.23 
 
 
589 aa  582  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50072  predicted protein  54.59 
 
 
505 aa  434  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.955215  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47781  predicted protein  45.69 
 
 
437 aa  346  7e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.938739  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49985  predicted protein  47.79 
 
 
505 aa  320  5e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48637  predicted protein  42.22 
 
 
551 aa  286  5.999999999999999e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48219  predicted protein  39.66 
 
 
480 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289088  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45969  predicted protein  33.6 
 
 
509 aa  210  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43280  predicted protein  29.75 
 
 
528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0677337  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  25.47 
 
 
555 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  21.52 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  26.73 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  26.27 
 
 
647 aa  67  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  24.4 
 
 
511 aa  67  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30899  AAAP family transporter: amino acid  21.46 
 
 
529 aa  65.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  24 
 
 
594 aa  60.8  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07777  amino acid transporter (Eurofung)  25.78 
 
 
580 aa  58.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.14577  normal  0.468629 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02460  transporter, putative  23.18 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10338  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09300)  24.56 
 
 
448 aa  47.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749689  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42888  predicted protein  23.18 
 
 
564 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0590475  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28839  AAAP family transporter: amino acid  23.79 
 
 
744 aa  43.5  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.046591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>