12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43280 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43280  predicted protein  100 
 
 
528 aa  1067    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0677337  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47781  predicted protein  27.97 
 
 
437 aa  133  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.938739  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50072  predicted protein  26.51 
 
 
505 aa  133  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.955215  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45969  predicted protein  24.2 
 
 
509 aa  117  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50146  predicted protein  28.34 
 
 
589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48219  predicted protein  25.84 
 
 
480 aa  107  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289088  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50071  predicted protein  29.75 
 
 
501 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0530284  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49985  predicted protein  26.52 
 
 
505 aa  104  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48637  predicted protein  28.22 
 
 
551 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  25.86 
 
 
555 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  20.3 
 
 
424 aa  44.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  22.82 
 
 
449 aa  44.3  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>