23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49073 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  100 
 
 
647 aa  1328    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  41.62 
 
 
594 aa  373  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  29.88 
 
 
555 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  30.79 
 
 
511 aa  158  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  27.35 
 
 
424 aa  132  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45915  AAAP family transporter: amino acid  25.54 
 
 
474 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40731  predicted protein  25.99 
 
 
584 aa  82  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247124  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47781  predicted protein  25.71 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.938739  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  22.86 
 
 
449 aa  73.2  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  23.95 
 
 
472 aa  72  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30899  AAAP family transporter: amino acid  22.86 
 
 
529 aa  70.9  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10338  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09300)  23.91 
 
 
448 aa  70.5  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749689  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49391  predicted protein  27.79 
 
 
538 aa  70.1  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49278  predicted protein  23.7 
 
 
618 aa  63.9  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50072  predicted protein  25.23 
 
 
505 aa  62.4  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.955215  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50071  predicted protein  25.4 
 
 
501 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0530284  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45969  predicted protein  21.36 
 
 
509 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02460  transporter, putative  22.3 
 
 
482 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42888  predicted protein  20.29 
 
 
564 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0590475  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50146  predicted protein  24.27 
 
 
589 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40517  predicted protein  22.31 
 
 
501 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299005  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49985  predicted protein  28.43 
 
 
505 aa  44.3  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9355  predicted protein  19.23 
 
 
393 aa  43.9  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0272446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>