12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45824 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45824  predicted protein  100 
 
 
580 aa  1189    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122291  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39978  predicted protein  45.09 
 
 
688 aa  405  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07777  amino acid transporter (Eurofung)  23.16 
 
 
580 aa  91.3  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.14577  normal  0.468629 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40517  predicted protein  26.71 
 
 
501 aa  81.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299005  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04477  amino acid transporter (Eurofung)  24.68 
 
 
739 aa  77.8  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06100  conserved hypothetical protein  22.93 
 
 
819 aa  68.2  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0680473  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81023  predicted protein  22.18 
 
 
670 aa  65.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87014  predicted protein  25.45 
 
 
621 aa  65.5  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.728691  normal  0.601954 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49568  predicted protein  22.89 
 
 
605 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110101  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  20.16 
 
 
472 aa  54.3  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_25632  AAAP family transporter: amino acid  21.17 
 
 
467 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45915  AAAP family transporter: amino acid  19.54 
 
 
474 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>