32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_51621 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_51621  predicted protein  100 
 
 		 372 aa  760    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0478079 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07471  IdgA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G05800)  32.55 
 
 		 735 aa  139  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320097  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02430  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 		 759 aa  67.4  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  26.15 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  28.65 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  26.55 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  27.84 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  27.84 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  27.84 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  25.81 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  27.84 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  28.98 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  28.98 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  28.98 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  28.41 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  24.06 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  24.66 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  26.09 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  24.07 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  24.41 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  27.7 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  27.7 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  23.47 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  23.47 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  23.47 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  23.47 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  23.47 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  26.86 
 
 		 312 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  23.47 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  23.47 
 
 		 362 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  26.11 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  26.92 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>