29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30587 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30587  Zn finger-containing GTPase- Activating Protein for ARF  100 
 
 		 368 aa  760    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.930878  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05690  ARF GTPase activator, putative  38.21 
 
 		 416 aa  223  4e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02222  zinc finger protein gcs1 (AFU_orthologue; AFUA_5G07130)  43.3 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0869741  normal  0.29351 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30686  predicted protein  40.16 
 
 		 528 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3230  predicted protein  31.58 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18895  normal  0.891214 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50442  predicted protein  50 
 
 		 196 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526697  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06033  ARF GTPase activator (Glo3), putative (Eurofung)  48.96 
 
 		 496 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03190  ARF GTPase activator, putative  39.84 
 
 		 537 aa  99.4  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.074845  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65149  GTP-ase activating protein for Arf  40 
 
 		 473 aa  99  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.150511  normal  0.859506 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23957  predicted protein  37.6 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.502271  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47899  predicted protein  45.88 
 
 		 198 aa  95.9  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_7988  predicted protein  56.34 
 
 		 74 aa  94  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01931  stromal membrane-associated protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07830)  38.89 
 
 		 565 aa  89.7  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.283365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83616  zinc finger protein  38.1 
 
 		 370 aa  89.7  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.511867  normal  0.153049 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21791  predicted protein  44.79 
 
 		 208 aa  89  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0609833  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04680  conserved hypothetical protein  36.11 
 
 		 438 aa  87.4  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43597  predicted protein  44.58 
 
 		 126 aa  85.9  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268453 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01629  GTPase activating protein for Arf, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09120)  32.38 
 
 		 621 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07950  conserved hypothetical protein  34.82 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893063  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27255  predicted protein  59.09 
 
 		 622 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0830887 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29655  predicted protein  59.09 
 
 		 622 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.233661  normal  0.159292 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_8461  predicted protein  61.7 
 
 		 53 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0505148  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9123  predicted protein  55.32 
 
 		 52 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04274  ARF GTPase activator (Csx2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03790)  48.33 
 
 		 1113 aa  66.2  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200938  normal  0.10616 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01270  conserved hypothetical protein  40.58 
 
 		 1175 aa  62.8  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00191487  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90941  protein (LSR1 protein)  29.01 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48638  GTPase activating protein  30.26 
 
 		 965 aa  56.6  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0963315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30703  predicted protein  31.76 
 
 		 570 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.255463 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42776  predicted protein  33.33 
 
 		 976 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.161289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>