27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9123 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9123  predicted protein  100 
 
 
52 aa  107  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30686  predicted protein  64.15 
 
 
528 aa  77  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29655  predicted protein  66.67 
 
 
622 aa  76.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.233661  normal  0.159292 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27255  predicted protein  66.67 
 
 
622 aa  76.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0830887 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3230  predicted protein  59.18 
 
 
313 aa  71.2  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18895  normal  0.891214 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04274  ARF GTPase activator (Csx2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03790)  59.18 
 
 
1113 aa  70.5  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200938  normal  0.10616 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30587  Zn finger-containing GTPase- Activating Protein for ARF  55.32 
 
 
368 aa  70.1  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.930878  normal 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_7988  predicted protein  59.18 
 
 
74 aa  70.1  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01629  GTPase activating protein for Arf, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09120)  51.02 
 
 
621 aa  69.7  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03190  ARF GTPase activator, putative  55.1 
 
 
537 aa  68.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.074845  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65149  GTP-ase activating protein for Arf  57.14 
 
 
473 aa  69.3  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.150511  normal  0.859506 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07950  conserved hypothetical protein  49.02 
 
 
416 aa  67  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893063  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23957  predicted protein  56.25 
 
 
431 aa  67  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.502271  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04680  conserved hypothetical protein  54.17 
 
 
438 aa  65.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05690  ARF GTPase activator, putative  50 
 
 
416 aa  65.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50442  predicted protein  50.98 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526697  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06033  ARF GTPase activator (Glo3), putative (Eurofung)  56.82 
 
 
496 aa  64.3  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01931  stromal membrane-associated protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07830)  48.08 
 
 
565 aa  64.3  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.283365  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83616  zinc finger protein  52.94 
 
 
370 aa  62.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.511867  normal  0.153049 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02222  zinc finger protein gcs1 (AFU_orthologue; AFUA_5G07130)  45.1 
 
 
422 aa  62.8  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0869741  normal  0.29351 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43597  predicted protein  56.25 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268453 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_8461  predicted protein  54 
 
 
53 aa  61.6  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0505148  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47899  predicted protein  50 
 
 
198 aa  61.6  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48638  GTPase activating protein  46 
 
 
965 aa  60.5  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0963315  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21791  predicted protein  43.33 
 
 
208 aa  53.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0609833  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01270  conserved hypothetical protein  41.07 
 
 
1175 aa  52  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00191487  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90941  protein (LSR1 protein)  41.67 
 
 
444 aa  49.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal  0.576221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>