26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48638 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_48638  GTPase activating protein  100 
 
 		 965 aa  1959    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0963315  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04274  ARF GTPase activator (Csx2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03790)  24.84 
 
 		 1113 aa  158  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200938  normal  0.10616 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01931  stromal membrane-associated protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07830)  30.1 
 
 		 565 aa  72.8  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.283365  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01629  GTPase activating protein for Arf, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09120)  32.76 
 
 		 621 aa  71.2  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83616  zinc finger protein  34.71 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.511867  normal  0.153049 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29655  predicted protein  27.31 
 
 		 622 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.233661  normal  0.159292 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27255  predicted protein  27.31 
 
 		 622 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0830887 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43597  predicted protein  30.36 
 
 		 126 aa  63.9  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268453 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04680  conserved hypothetical protein  32.04 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07950  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893063  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_7988  predicted protein  33.8 
 
 		 74 aa  60.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9123  predicted protein  46 
 
 		 52 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05690  ARF GTPase activator, putative  28.71 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01270  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 		 1175 aa  57.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00191487  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30587  Zn finger-containing GTPase- Activating Protein for ARF  30.26 
 
 		 368 aa  56.6  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.930878  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06033  ARF GTPase activator (Glo3), putative (Eurofung)  33.8 
 
 		 496 aa  57  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90941  protein (LSR1 protein)  32 
 
 		 444 aa  56.2  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30686  predicted protein  29.21 
 
 		 528 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02222  zinc finger protein gcs1 (AFU_orthologue; AFUA_5G07130)  31.94 
 
 		 422 aa  56.2  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0869741  normal  0.29351 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21791  predicted protein  30.17 
 
 		 208 aa  54.7  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0609833  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50442  predicted protein  31.31 
 
 		 196 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526697  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65149  GTP-ase activating protein for Arf  31.51 
 
 		 473 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.150511  normal  0.859506 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03190  ARF GTPase activator, putative  32.88 
 
 		 537 aa  50.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.074845  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23957  predicted protein  32.69 
 
 		 431 aa  48.1  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.502271  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3230  predicted protein  28.85 
 
 		 313 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18895  normal  0.891214 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47899  predicted protein  28.26 
 
 		 198 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>