28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47899 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47899  predicted protein  100 
 
 		 198 aa  413  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3230  predicted protein  40 
 
 		 313 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18895  normal  0.891214 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05690  ARF GTPase activator, putative  43.59 
 
 		 416 aa  101  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30686  predicted protein  42.28 
 
 		 528 aa  99.4  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30587  Zn finger-containing GTPase- Activating Protein for ARF  45.88 
 
 		 368 aa  95.9  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.930878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23957  predicted protein  38.64 
 
 		 431 aa  95.5  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.502271  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02222  zinc finger protein gcs1 (AFU_orthologue; AFUA_5G07130)  36.8 
 
 		 422 aa  92.8  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0869741  normal  0.29351 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03190  ARF GTPase activator, putative  34.4 
 
 		 537 aa  90.5  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.074845  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_7988  predicted protein  53.52 
 
 		 74 aa  88.6  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50442  predicted protein  34.4 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526697  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06033  ARF GTPase activator (Glo3), putative (Eurofung)  38.14 
 
 		 496 aa  85.9  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27255  predicted protein  36.3 
 
 		 622 aa  81.3  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0830887 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29655  predicted protein  36.3 
 
 		 622 aa  81.3  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.233661  normal  0.159292 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65149  GTP-ase activating protein for Arf  38.32 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.150511  normal  0.859506 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04680  conserved hypothetical protein  39.74 
 
 		 438 aa  78.6  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_8461  predicted protein  62.26 
 
 		 53 aa  75.5  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0505148  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21791  predicted protein  40.66 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0609833  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01629  GTPase activating protein for Arf, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09120)  42.03 
 
 		 621 aa  73.2  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01931  stromal membrane-associated protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07830)  31.82 
 
 		 565 aa  71.2  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.283365  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07950  conserved hypothetical protein  38.89 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893063  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83616  zinc finger protein  36.25 
 
 		 370 aa  68.9  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.511867  normal  0.153049 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01270  conserved hypothetical protein  37.21 
 
 		 1175 aa  62  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00191487  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04274  ARF GTPase activator (Csx2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03790)  39.71 
 
 		 1113 aa  61.6  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200938  normal  0.10616 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9123  predicted protein  50 
 
 		 52 aa  61.6  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43597  predicted protein  35.71 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268453 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90941  protein (LSR1 protein)  28.57 
 
 		 444 aa  51.6  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48638  GTPase activating protein  28.26 
 
 		 965 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0963315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42776  predicted protein  31.11 
 
 		 976 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.161289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>