20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42776 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42776  predicted protein  100 
 
 
976 aa  1955    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.161289  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30703  predicted protein  31.45 
 
 
570 aa  70.1  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.255463 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83616  zinc finger protein  29.5 
 
 
370 aa  65.5  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.511867  normal  0.153049 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01931  stromal membrane-associated protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07830)  30.58 
 
 
565 aa  63.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.283365  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07950  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 
416 aa  63.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893063  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01629  GTPase activating protein for Arf, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09120)  31.09 
 
 
621 aa  62.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04680  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
438 aa  58.2  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01270  conserved hypothetical protein  29.17 
 
 
1175 aa  55.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00191487  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49833  predicted protein  30.23 
 
 
470 aa  55.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.523425  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3230  predicted protein  36.36 
 
 
313 aa  55.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18895  normal  0.891214 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04274  ARF GTPase activator (Csx2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03790)  30.17 
 
 
1113 aa  54.7  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200938  normal  0.10616 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02222  zinc finger protein gcs1 (AFU_orthologue; AFUA_5G07130)  31.76 
 
 
422 aa  54.3  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0869741  normal  0.29351 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21791  predicted protein  27.82 
 
 
208 aa  51.6  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0609833  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30587  Zn finger-containing GTPase- Activating Protein for ARF  33.33 
 
 
368 aa  48.5  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.930878  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43597  predicted protein  35.14 
 
 
126 aa  48.1  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268453 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05690  ARF GTPase activator, putative  25.33 
 
 
416 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30686  predicted protein  26.27 
 
 
528 aa  45.8  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_7988  predicted protein  32.31 
 
 
74 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23957  predicted protein  28.74 
 
 
431 aa  45.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.502271  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65149  GTP-ase activating protein for Arf  29.85 
 
 
473 aa  45.4  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.150511  normal  0.859506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>