29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3230 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_3230  predicted protein  100 
 
 
313 aa  637    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18895  normal  0.891214 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05690  ARF GTPase activator, putative  41.63 
 
 
416 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30686  predicted protein  60.68 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30587  Zn finger-containing GTPase- Activating Protein for ARF  31.86 
 
 
368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.930878  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50442  predicted protein  39.86 
 
 
196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526697  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23957  predicted protein  48.84 
 
 
431 aa  113  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.502271  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03190  ARF GTPase activator, putative  41.18 
 
 
537 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.074845  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_7988  predicted protein  69.01 
 
 
74 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47899  predicted protein  40 
 
 
198 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65149  GTP-ase activating protein for Arf  37.68 
 
 
473 aa  106  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.150511  normal  0.859506 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02222  zinc finger protein gcs1 (AFU_orthologue; AFUA_5G07130)  30.05 
 
 
422 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0869741  normal  0.29351 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06033  ARF GTPase activator (Glo3), putative (Eurofung)  41.44 
 
 
496 aa  99.8  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83616  zinc finger protein  40.59 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.511867  normal  0.153049 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04680  conserved hypothetical protein  43.21 
 
 
438 aa  90.1  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07950  conserved hypothetical protein  36.62 
 
 
416 aa  89.4  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893063  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01629  GTPase activating protein for Arf, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09120)  36.11 
 
 
621 aa  89  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21791  predicted protein  43.96 
 
 
208 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0609833  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43597  predicted protein  48.1 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268453 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01931  stromal membrane-associated protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07830)  36.54 
 
 
565 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.283365  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01270  conserved hypothetical protein  43.02 
 
 
1175 aa  73.9  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00191487  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27255  predicted protein  47.44 
 
 
622 aa  73.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0830887 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29655  predicted protein  47.44 
 
 
622 aa  73.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.233661  normal  0.159292 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9123  predicted protein  59.18 
 
 
52 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_8461  predicted protein  56.6 
 
 
53 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0505148  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04274  ARF GTPase activator (Csx2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03790)  42.17 
 
 
1113 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200938  normal  0.10616 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42776  predicted protein  36.36 
 
 
976 aa  56.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.161289  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90941  protein (LSR1 protein)  34.38 
 
 
444 aa  53.5  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48638  GTPase activating protein  28.85 
 
 
965 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0963315  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30703  predicted protein  33.33 
 
 
570 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.255463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>