29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ01270 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ01270  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1175 aa  2406    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00191487  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01931  stromal membrane-associated protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07830)  41.46 
 
 
565 aa  105  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.283365  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04680  conserved hypothetical protein  42.74 
 
 
438 aa  103  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83616  zinc finger protein  44.17 
 
 
370 aa  99.4  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.511867  normal  0.153049 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07950  conserved hypothetical protein  34.68 
 
 
416 aa  89  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893063  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01629  GTPase activating protein for Arf, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09120)  34.96 
 
 
621 aa  83.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04274  ARF GTPase activator (Csx2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03790)  36.44 
 
 
1113 aa  78.6  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200938  normal  0.10616 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_7988  predicted protein  45.57 
 
 
74 aa  77.4  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29655  predicted protein  34.78 
 
 
622 aa  73.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.233661  normal  0.159292 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43597  predicted protein  37.39 
 
 
126 aa  74.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268453 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27255  predicted protein  34.78 
 
 
622 aa  73.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0830887 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3230  predicted protein  43.02 
 
 
313 aa  74.3  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18895  normal  0.891214 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21791  predicted protein  31.69 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0609833  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05690  ARF GTPase activator, putative  38.27 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30686  predicted protein  39.13 
 
 
528 aa  68.6  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30587  Zn finger-containing GTPase- Activating Protein for ARF  40.58 
 
 
368 aa  62.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.930878  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47899  predicted protein  37.21 
 
 
198 aa  61.6  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03190  ARF GTPase activator, putative  32 
 
 
537 aa  61.6  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.074845  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50442  predicted protein  40.74 
 
 
196 aa  59.7  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526697  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06033  ARF GTPase activator (Glo3), putative (Eurofung)  33.33 
 
 
496 aa  58.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23957  predicted protein  33.33 
 
 
431 aa  58.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.502271  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90941  protein (LSR1 protein)  25.98 
 
 
444 aa  57.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48638  GTPase activating protein  25.69 
 
 
965 aa  57.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0963315  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42776  predicted protein  29.17 
 
 
976 aa  55.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.161289  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02222  zinc finger protein gcs1 (AFU_orthologue; AFUA_5G07130)  39.39 
 
 
422 aa  55.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0869741  normal  0.29351 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65149  GTP-ase activating protein for Arf  29.27 
 
 
473 aa  55.5  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.150511  normal  0.859506 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9123  predicted protein  41.07 
 
 
52 aa  51.6  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49833  predicted protein  28.1 
 
 
470 aa  48.9  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.523425  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30703  predicted protein  29.81 
 
 
570 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.255463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>