30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA07950 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA07950  conserved hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  857    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893063  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01629  GTPase activating protein for Arf, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09120)  48.46 
 
 
621 aa  139  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04680  conserved hypothetical protein  44.35 
 
 
438 aa  117  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01931  stromal membrane-associated protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07830)  44.83 
 
 
565 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.283365  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83616  zinc finger protein  43.97 
 
 
370 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.511867  normal  0.153049 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43597  predicted protein  42.62 
 
 
126 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268453 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90941  protein (LSR1 protein)  38.36 
 
 
444 aa  98.2  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3230  predicted protein  36.62 
 
 
313 aa  90.5  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18895  normal  0.891214 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30686  predicted protein  45.88 
 
 
528 aa  90.5  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05690  ARF GTPase activator, putative  43.04 
 
 
416 aa  90.1  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01270  conserved hypothetical protein  34.68 
 
 
1175 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00191487  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03190  ARF GTPase activator, putative  46.58 
 
 
537 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.074845  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50442  predicted protein  37.4 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526697  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23957  predicted protein  38.55 
 
 
431 aa  82.8  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.502271  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21791  predicted protein  31.58 
 
 
208 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0609833  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04274  ARF GTPase activator (Csx2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03790)  36.7 
 
 
1113 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200938  normal  0.10616 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65149  GTP-ase activating protein for Arf  42.5 
 
 
473 aa  81.3  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.150511  normal  0.859506 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30587  Zn finger-containing GTPase- Activating Protein for ARF  34.82 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.930878  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27255  predicted protein  39.82 
 
 
622 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0830887 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29655  predicted protein  39.82 
 
 
622 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.233661  normal  0.159292 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02222  zinc finger protein gcs1 (AFU_orthologue; AFUA_5G07130)  38.46 
 
 
422 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0869741  normal  0.29351 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_7988  predicted protein  45.59 
 
 
74 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06033  ARF GTPase activator (Glo3), putative (Eurofung)  33.68 
 
 
496 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30703  predicted protein  36.36 
 
 
570 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.255463 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47899  predicted protein  38.89 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9123  predicted protein  49.02 
 
 
52 aa  67  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42776  predicted protein  28.91 
 
 
976 aa  62.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.161289  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48638  GTPase activating protein  32.08 
 
 
965 aa  61.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0963315  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_8461  predicted protein  49.06 
 
 
53 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0505148  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49833  predicted protein  23.39 
 
 
470 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.523425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>