More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29793 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_29793  predicted protein  100 
 
 
424 aa  875    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.832112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.5 
 
 
287 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  35.43 
 
 
286 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  35.05 
 
 
283 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  31.47 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  34.9 
 
 
325 aa  121  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  36.55 
 
 
288 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  34.54 
 
 
289 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.6 
 
 
286 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  37.24 
 
 
284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.44 
 
 
276 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.46 
 
 
293 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.6 
 
 
293 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  33.2 
 
 
302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  30.57 
 
 
271 aa  117  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  33.73 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.13 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  37.21 
 
 
284 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  31.84 
 
 
288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  33.85 
 
 
284 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  35.24 
 
 
280 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 
293 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.92 
 
 
283 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  29.66 
 
 
281 aa  114  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  35.48 
 
 
297 aa  113  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  31.87 
 
 
283 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  35.65 
 
 
286 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.54 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  32.27 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  35.39 
 
 
283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  34.58 
 
 
294 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  31.95 
 
 
282 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  31.54 
 
 
283 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  31.54 
 
 
283 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  31.06 
 
 
286 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.91 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  33.47 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.66 
 
 
286 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 
283 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  34 
 
 
289 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  31.15 
 
 
283 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.75 
 
 
283 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  31.15 
 
 
283 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  31.09 
 
 
308 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  33.08 
 
 
338 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  39.2 
 
 
298 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  35.17 
 
 
282 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.43 
 
 
277 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  31.71 
 
 
285 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  34.38 
 
 
299 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  31.84 
 
 
283 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.52 
 
 
276 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  33.86 
 
 
288 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  34.75 
 
 
276 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  35.18 
 
 
295 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  27.38 
 
 
282 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  33.2 
 
 
301 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  33.6 
 
 
280 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.58 
 
 
297 aa  106  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  36.89 
 
 
295 aa  107  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.47 
 
 
276 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  32.65 
 
 
279 aa  106  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.67 
 
 
280 aa  106  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  32.16 
 
 
270 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  32.41 
 
 
285 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  33.03 
 
 
288 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  34.15 
 
 
289 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36 
 
 
285 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  31.97 
 
 
295 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.61 
 
 
281 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1660  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.86 
 
 
287 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  31.33 
 
 
307 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  31.45 
 
 
287 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  33.85 
 
 
289 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  32.68 
 
 
279 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  35.04 
 
 
277 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1845  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  30.9 
 
 
306 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0122035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.76 
 
 
280 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  32.41 
 
 
276 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.36 
 
 
288 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  32.94 
 
 
278 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  34.45 
 
 
274 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.05 
 
 
313 aa  103  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  28.89 
 
 
262 aa  103  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  32.54 
 
 
276 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.27 
 
 
280 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  31.2 
 
 
285 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  30.96 
 
 
286 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  34.14 
 
 
285 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.97 
 
 
289 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  35.71 
 
 
317 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  31.73 
 
 
280 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  32.39 
 
 
284 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  31.73 
 
 
280 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
285 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03501  putative protein methyltransferase  32.3 
 
 
289 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  31.4 
 
 
285 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.95 
 
 
276 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  33.76 
 
 
274 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  35.18 
 
 
280 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>