43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3964 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3964  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1833  hypothetical protein  56.54 
 
 
261 aa  304  9.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0782  hypothetical protein  54.02 
 
 
266 aa  301  5.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0144057  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0416  hypothetical protein  54.65 
 
 
262 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.306118  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0406  hypothetical protein  54.65 
 
 
262 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2614  haloacid dehalogenase-like hydrolase  52.87 
 
 
268 aa  280  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3995  hypothetical protein  48.83 
 
 
269 aa  258  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.823867  hitchhiker  0.00000204012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0627  hypothetical protein  38.74 
 
 
254 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.131401  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27056  predicted protein  32.95 
 
 
274 aa  135  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496762  hitchhiker  0.000240324 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16801  hypothetical protein  31.7 
 
 
258 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1950  hypothetical protein  28.46 
 
 
249 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0380  hypothetical protein  27.86 
 
 
249 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1653  hypothetical protein  30.77 
 
 
260 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.428173  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22981  phosphatase  29.06 
 
 
258 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1132  HAD family phosphatase  29.39 
 
 
259 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17681  phosphatases  30.38 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.265006  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20061  phosphatases  29.01 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235525  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17521  phosphatase  29.08 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17431  phosphatase  29.18 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.196144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2829  hypothetical protein  22.17 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  25.16 
 
 
250 aa  49.3  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  26.77 
 
 
229 aa  48.9  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  22.63 
 
 
261 aa  45.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  22.29 
 
 
226 aa  45.4  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  26.19 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  24.6 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  23.88 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  23.02 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  23.62 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  25.68 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  23.62 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  30.36 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  21.26 
 
 
216 aa  43.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
229 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 
272 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  25.98 
 
 
229 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  22.99 
 
 
227 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
272 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  24.41 
 
 
225 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
257 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 
272 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>