More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0468 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0468  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 704 aa  1437    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  39.34 
 
 		 5953 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  32.81 
 
 		 2063 aa  308  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  29.76 
 
 		 6404 aa  300  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2569  amino acid adenylation domain-containing protein  31.22 
 
 		 2971 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188555 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7311  peptide synthetase  36.94 
 
 		 2183 aa  298  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  38.82 
 
 		 5596 aa  297  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  39.5 
 
 		 3629 aa  296  8e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  39.29 
 
 		 4489 aa  293  6e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  37.01 
 
 		 2883 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  32.5 
 
 		 3235 aa  292  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  36.67 
 
 		 4882 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1176  amino acid adenylation  34.74 
 
 		 1621 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  35.6 
 
 		 2581 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  38.62 
 
 		 7310 aa  288  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  38.54 
 
 		 3331 aa  284  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  36.49 
 
 		 2561 aa  283  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5090  amino acid adenylation domain protein  37.14 
 
 		 1153 aa  283  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2102  amino acid adenylation domain-containing protein  32.26 
 
 		 1481 aa  282  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.73819  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  37.1 
 
 		 2684 aa  281  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  35.19 
 
 		 2682 aa  281  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4625  amino acid adenylation domain-containing protein  37.71 
 
 		 1153 aa  280  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  37.4 
 
 		 5750 aa  279  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  34.72 
 
 		 1870 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.26 
 
 		 2385 aa  278  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  36.1 
 
 		 3335 aa  278  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  38 
 
 		 8915 aa  277  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  35.25 
 
 		 2710 aa  277  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.48 
 
 		 3432 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  34.51 
 
 		 1129 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  38 
 
 		 8914 aa  276  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.61 
 
 		 2385 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.26 
 
 		 2385 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  32.55 
 
 		 5467 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  33.89 
 
 		 1870 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  35.47 
 
 		 2820 aa  274  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1976  amino acid adenylation  34.46 
 
 		 1373 aa  273  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  32.99 
 
 		 4747 aa  272  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1907  amino acid adenylation domain-containing protein  33.95 
 
 		 625 aa  271  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5163  amino acid adenylation domain protein  36.2 
 
 		 1174 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0962638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  35.21 
 
 		 2386 aa  270  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  38.32 
 
 		 6403 aa  269  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.61 
 
 		 2385 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1434  amino acid adenylation domain protein  33.88 
 
 		 877 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  37.67 
 
 		 2137 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  35.23 
 
 		 1334 aa  268  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  37.68 
 
 		 2187 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  37.47 
 
 		 3235 aa  266  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  35.76 
 
 		 1336 aa  266  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  32.64 
 
 		 2385 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  32.99 
 
 		 2385 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.85 
 
 		 2385 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  35.05 
 
 		 3470 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  37.47 
 
 		 2333 aa  264  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  35.05 
 
 		 6999 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.64 
 
 		 2385 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.64 
 
 		 2385 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  36.55 
 
 		 2679 aa  262  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  32.44 
 
 		 2386 aa  262  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  35.5 
 
 		 4991 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3742  amino acid adenylation domain protein  34.94 
 
 		 1358 aa  260  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.798811  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1678  amino acid adenylation domain protein  36.86 
 
 		 1393 aa  260  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147696  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.57 
 
 		 3925 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  35.2 
 
 		 4183 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6835  amino acid adenylation domain-containing protein  36.73 
 
 		 655 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  34.62 
 
 		 1282 aa  256  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.4 
 
 		 3231 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  35.85 
 
 		 2883 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  31.06 
 
 		 2845 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  35.89 
 
 		 6176 aa  253  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  34.53 
 
 		 4090 aa  252  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  33.69 
 
 		 6661 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2106  amino acid adenylation domain-containing protein  34.58 
 
 		 1927 aa  251  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  33.99 
 
 		 2106 aa  251  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  36.14 
 
 		 3328 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  36.14 
 
 		 3352 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  31.24 
 
 		 2626 aa  249  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1568  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaF  35.84 
 
 		 1530 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0140  putative non-ribosomal peptide/polyketide synthase  35.84 
 
 		 1534 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.393572  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  32.79 
 
 		 1525 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  35.94 
 
 		 6081 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1649  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaF  35.84 
 
 		 1534 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  34.33 
 
 		 1816 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  36.14 
 
 		 6072 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.16 
 
 		 6889 aa  247  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  35.74 
 
 		 6006 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  33.4 
 
 		 3695 aa  246  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  35.64 
 
 		 13537 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  36.75 
 
 		 8211 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0353  amino acid adenylation domain-containing protein  35.08 
 
 		 1054 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0224507  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2033  amino acid adenylation domain protein  33.11 
 
 		 1740 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0167329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3345  non-ribosomal peptide synthetase  35.23 
 
 		 1059 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  34.5 
 
 		 2419 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  33.61 
 
 		 1668 aa  244  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.12 
 
 		 2720 aa  243  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  31.05 
 
 		 5328 aa  243  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  33.04 
 
 		 2154 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  34.8 
 
 		 2651 aa  243  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  32.58 
 
 		 1405 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  33.06 
 
 		 1525 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>