43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0304 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0310  hypothetical protein  93.04 
 
 		 431 aa  837    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0304  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  889    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0201932  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3786  hypothetical protein  58.74 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0027021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3628  hypothetical protein  60.51 
 
 		 433 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3266  hypothetical protein  39.1 
 
 		 411 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.812163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0557  hypothetical protein  38.2 
 
 		 405 aa  265  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1284  hypothetical protein  40.83 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00324904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5170  hypothetical protein  42.9 
 
 		 432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4528  hypothetical protein  37.22 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal  0.0430352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3705  hypothetical protein  39.94 
 
 		 388 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4020  hypothetical protein  39.94 
 
 		 388 aa  243  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3571  hypothetical protein  39.94 
 
 		 388 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4015  hypothetical protein  35.61 
 
 		 407 aa  229  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3710  hypothetical protein  35.61 
 
 		 407 aa  229  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3576  hypothetical protein  35.61 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0823  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2696  hypothetical protein  33.96 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000585774  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0086  hypothetical protein  32.56 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4715  hypothetical protein  31.55 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0778  hypothetical protein  34.49 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47597  predicted protein  31.79 
 
 		 810 aa  154  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50635  predicted protein  30.12 
 
 		 843 aa  151  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46249  predicted protein  29.48 
 
 		 831 aa  143  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849514  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36106  predicted protein  29.2 
 
 		 827 aa  143  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01520  conserved expressed protein  32.19 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36118  predicted protein  29.76 
 
 		 880 aa  129  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0289305  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47518  predicted protein  27.16 
 
 		 953 aa  126  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49115  predicted protein  24.32 
 
 		 870 aa  96.7  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00818275  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40644  predicted protein  23.75 
 
 		 876 aa  63.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3252  hypothetical protein  30.48 
 
 		 372 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2760  hypothetical protein  22.22 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.120597 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3930  hypothetical protein  30.48 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2992  hypothetical protein  30.48 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0130  hypothetical protein  30.48 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3313  hypothetical protein  30.48 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1545  hypothetical protein  30.48 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4001  hypothetical protein  30.48 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3057  hypothetical protein  30.48 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0053  hypothetical protein  24.06 
 
 		 376 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0140  hypothetical protein  26.73 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.705412 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3014  hypothetical protein  24.86 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0130  hypothetical protein  28.16 
 
 		 378 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0142  hypothetical protein  28.16 
 
 		 378 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>