32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0557 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0557  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  837    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116772  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4528  hypothetical protein  55.01 
 
 
402 aa  418  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal  0.0430352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3266  hypothetical protein  40.29 
 
 
411 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.812163  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3571  hypothetical protein  42.14 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4020  hypothetical protein  42.14 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3705  hypothetical protein  42.14 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1284  hypothetical protein  40.35 
 
 
446 aa  279  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00324904  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3576  hypothetical protein  40.84 
 
 
410 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4015  hypothetical protein  40.84 
 
 
407 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3710  hypothetical protein  40.84 
 
 
407 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0304  hypothetical protein  38.2 
 
 
431 aa  265  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0201932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5170  hypothetical protein  39.47 
 
 
432 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3786  hypothetical protein  39.14 
 
 
434 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0027021  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0310  hypothetical protein  36.87 
 
 
431 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3628  hypothetical protein  41.23 
 
 
433 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0823  hypothetical protein  34.47 
 
 
1256 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4715  hypothetical protein  33.66 
 
 
394 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0086  hypothetical protein  33.86 
 
 
384 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2696  hypothetical protein  32.07 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000585774  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36106  predicted protein  33.01 
 
 
827 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50635  predicted protein  29.88 
 
 
843 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0778  hypothetical protein  32.17 
 
 
340 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01520  conserved expressed protein  30 
 
 
472 aa  143  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46249  predicted protein  31.51 
 
 
831 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849514  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47597  predicted protein  27.49 
 
 
810 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36118  predicted protein  28.34 
 
 
880 aa  116  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0289305  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47518  predicted protein  28.16 
 
 
953 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49115  predicted protein  25.44 
 
 
870 aa  85.5  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00818275  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40644  predicted protein  22.31 
 
 
876 aa  66.6  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3883  hypothetical protein  24.11 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0053  hypothetical protein  23.66 
 
 
376 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3252  hypothetical protein  20.92 
 
 
372 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>