30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3710 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3710  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  843    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3576  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  836    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4015  hypothetical protein  99.75 
 
 		 407 aa  841    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3705  hypothetical protein  42.2 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3571  hypothetical protein  42.2 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4020  hypothetical protein  42.2 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4528  hypothetical protein  38.86 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal  0.0430352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0557  hypothetical protein  40.84 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1284  hypothetical protein  41.11 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00324904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3266  hypothetical protein  37.54 
 
 		 411 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.812163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3786  hypothetical protein  34.64 
 
 		 434 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0027021  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0310  hypothetical protein  35.63 
 
 		 431 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0304  hypothetical protein  35.61 
 
 		 431 aa  229  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0201932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3628  hypothetical protein  34.94 
 
 		 433 aa  229  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5170  hypothetical protein  37.21 
 
 		 432 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0823  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1256 aa  195  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2696  hypothetical protein  38.03 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000585774  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0086  hypothetical protein  35 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4715  hypothetical protein  31.88 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36106  predicted protein  29.94 
 
 		 827 aa  152  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46249  predicted protein  29.07 
 
 		 831 aa  148  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849514  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47597  predicted protein  27.52 
 
 		 810 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50635  predicted protein  30.28 
 
 		 843 aa  143  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0778  hypothetical protein  30.72 
 
 		 340 aa  140  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01520  conserved expressed protein  32.08 
 
 		 472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36118  predicted protein  30.5 
 
 		 880 aa  125  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0289305  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47518  predicted protein  25.14 
 
 		 953 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49115  predicted protein  27.2 
 
 		 870 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00818275  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40644  predicted protein  26.78 
 
 		 876 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00530  hypothetical protein  23.79 
 
 		 340 aa  43.5  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>