30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1284 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1284  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  927    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00324904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0557  hypothetical protein  40.35 
 
 		 405 aa  279  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4528  hypothetical protein  40.23 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal  0.0430352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3571  hypothetical protein  40.06 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4020  hypothetical protein  40.06 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3705  hypothetical protein  40.06 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0304  hypothetical protein  40.83 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0201932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3266  hypothetical protein  34.56 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.812163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0310  hypothetical protein  40.14 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3576  hypothetical protein  41.11 
 
 		 410 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3710  hypothetical protein  41.11 
 
 		 407 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4015  hypothetical protein  41.11 
 
 		 407 aa  243  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3786  hypothetical protein  35.83 
 
 		 434 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0027021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3628  hypothetical protein  35.04 
 
 		 433 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5170  hypothetical protein  39.13 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0823  hypothetical protein  35.28 
 
 		 1256 aa  215  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2696  hypothetical protein  37.41 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000585774  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4715  hypothetical protein  35.97 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50635  predicted protein  33.8 
 
 		 843 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0086  hypothetical protein  35.69 
 
 		 384 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47597  predicted protein  35.41 
 
 		 810 aa  166  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36106  predicted protein  35.18 
 
 		 827 aa  164  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46249  predicted protein  33.54 
 
 		 831 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849514  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01520  conserved expressed protein  32.84 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0778  hypothetical protein  35.21 
 
 		 340 aa  152  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36118  predicted protein  29.04 
 
 		 880 aa  139  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0289305  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47518  predicted protein  30.3 
 
 		 953 aa  133  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49115  predicted protein  28.03 
 
 		 870 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00818275  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40644  predicted protein  23.98 
 
 		 876 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2760  hypothetical protein  26.47 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.120597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>