32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0310 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0310  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  889    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0304  hypothetical protein  93.04 
 
 
431 aa  837    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0201932  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3786  hypothetical protein  58.88 
 
 
434 aa  523  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0027021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3628  hypothetical protein  60.89 
 
 
433 aa  511  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3266  hypothetical protein  38.56 
 
 
411 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.812163  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0557  hypothetical protein  36.87 
 
 
405 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116772  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4528  hypothetical protein  36.67 
 
 
402 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal  0.0430352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1284  hypothetical protein  40.14 
 
 
446 aa  250  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00324904  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5170  hypothetical protein  41.94 
 
 
432 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3705  hypothetical protein  37.83 
 
 
388 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4020  hypothetical protein  37.83 
 
 
388 aa  237  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3571  hypothetical protein  37.83 
 
 
388 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4015  hypothetical protein  35.63 
 
 
407 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3576  hypothetical protein  35.63 
 
 
410 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3710  hypothetical protein  35.63 
 
 
407 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0823  hypothetical protein  34.16 
 
 
1256 aa  193  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2696  hypothetical protein  34.32 
 
 
395 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000585774  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0086  hypothetical protein  31.89 
 
 
384 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4715  hypothetical protein  31.23 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0778  hypothetical protein  32.59 
 
 
340 aa  161  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47597  predicted protein  30.11 
 
 
810 aa  152  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50635  predicted protein  29.82 
 
 
843 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46249  predicted protein  29.48 
 
 
831 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849514  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36106  predicted protein  28.08 
 
 
827 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01520  conserved expressed protein  31.85 
 
 
472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36118  predicted protein  29.25 
 
 
880 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0289305  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47518  predicted protein  27.15 
 
 
953 aa  126  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49115  predicted protein  24.06 
 
 
870 aa  93.2  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00818275  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40644  predicted protein  23.81 
 
 
876 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3252  hypothetical protein  30.48 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2760  hypothetical protein  22.69 
 
 
385 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.120597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0140  hypothetical protein  26.17 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.705412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>