32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46249 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011701  PHATRDRAFT_50635  predicted protein  52.19 
 
 
843 aa  805    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47597  predicted protein  51.84 
 
 
810 aa  769    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46249  predicted protein  100 
 
 
831 aa  1736    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849514  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36118  predicted protein  47.3 
 
 
880 aa  687    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0289305  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36106  predicted protein  83.94 
 
 
827 aa  1459    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47518  predicted protein  42.11 
 
 
953 aa  589  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49115  predicted protein  37.22 
 
 
870 aa  500  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00818275  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0823  hypothetical protein  33.96 
 
 
1256 aa  362  2e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40644  predicted protein  31.23 
 
 
876 aa  355  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50634  predicted protein  45.55 
 
 
528 aa  355  2.9999999999999997e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.324652  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46198  predicted protein  44.01 
 
 
445 aa  259  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.930439  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36105  predicted protein  43.69 
 
 
419 aa  256  9e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.592861  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1284  hypothetical protein  33.54 
 
 
446 aa  158  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00324904  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5170  hypothetical protein  34.36 
 
 
432 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3576  hypothetical protein  29.07 
 
 
410 aa  148  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3710  hypothetical protein  29.07 
 
 
407 aa  148  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4015  hypothetical protein  28.8 
 
 
407 aa  147  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0310  hypothetical protein  29.48 
 
 
431 aa  144  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0304  hypothetical protein  29.48 
 
 
431 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0201932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3266  hypothetical protein  33 
 
 
411 aa  141  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.812163  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0557  hypothetical protein  31.51 
 
 
405 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116772  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3628  hypothetical protein  32.1 
 
 
433 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3786  hypothetical protein  32.42 
 
 
434 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0027021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4528  hypothetical protein  29.77 
 
 
402 aa  128  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal  0.0430352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3571  hypothetical protein  29.11 
 
 
388 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4020  hypothetical protein  29.11 
 
 
388 aa  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3705  hypothetical protein  29.11 
 
 
388 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4715  hypothetical protein  28.35 
 
 
394 aa  109  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2696  hypothetical protein  28.01 
 
 
395 aa  108  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000585774  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0086  hypothetical protein  27.35 
 
 
384 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0778  hypothetical protein  28.91 
 
 
340 aa  103  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01520  conserved expressed protein  27.16 
 
 
472 aa  100  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>