30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5170 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5170  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  870    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4528  hypothetical protein  41.3 
 
 
402 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal  0.0430352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0557  hypothetical protein  39.47 
 
 
405 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116772  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3266  hypothetical protein  40.64 
 
 
411 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.812163  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0304  hypothetical protein  38.46 
 
 
431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0201932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0310  hypothetical protein  37.67 
 
 
431 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1284  hypothetical protein  36.46 
 
 
446 aa  233  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00324904  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3786  hypothetical protein  40.07 
 
 
434 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0027021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3628  hypothetical protein  36.94 
 
 
433 aa  219  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3576  hypothetical protein  37.21 
 
 
410 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3710  hypothetical protein  37.21 
 
 
407 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4015  hypothetical protein  37.21 
 
 
407 aa  210  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3571  hypothetical protein  38.22 
 
 
388 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4020  hypothetical protein  38.22 
 
 
388 aa  206  8e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3705  hypothetical protein  38.22 
 
 
388 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4715  hypothetical protein  36.88 
 
 
394 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2696  hypothetical protein  35.79 
 
 
395 aa  166  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000585774  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0086  hypothetical protein  34.07 
 
 
384 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47597  predicted protein  33.77 
 
 
810 aa  157  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0823  hypothetical protein  31.37 
 
 
1256 aa  156  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36106  predicted protein  34.07 
 
 
827 aa  153  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46249  predicted protein  34.36 
 
 
831 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849514  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01520  conserved expressed protein  33 
 
 
472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50635  predicted protein  29.06 
 
 
843 aa  140  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0778  hypothetical protein  32.37 
 
 
340 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47518  predicted protein  29.14 
 
 
953 aa  117  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36118  predicted protein  28.89 
 
 
880 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0289305  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49115  predicted protein  27.18 
 
 
870 aa  84.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00818275  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40644  predicted protein  26.14 
 
 
876 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2760  hypothetical protein  25 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.120597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>