28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4715 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4715  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  822    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2696  hypothetical protein  65.57 
 
 
395 aa  555  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000585774  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0086  hypothetical protein  69.06 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0557  hypothetical protein  33.66 
 
 
405 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116772  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1284  hypothetical protein  35.97 
 
 
446 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00324904  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4528  hypothetical protein  34.98 
 
 
402 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal  0.0430352 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4020  hypothetical protein  35.57 
 
 
388 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3705  hypothetical protein  35.57 
 
 
388 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3571  hypothetical protein  35.57 
 
 
388 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3266  hypothetical protein  36.05 
 
 
411 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.812163  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5170  hypothetical protein  36.14 
 
 
432 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3786  hypothetical protein  34.55 
 
 
434 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0027021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0304  hypothetical protein  31.55 
 
 
431 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0201932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0310  hypothetical protein  31.23 
 
 
431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3710  hypothetical protein  31.88 
 
 
407 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4015  hypothetical protein  31.88 
 
 
407 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3576  hypothetical protein  31.88 
 
 
410 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3628  hypothetical protein  33.11 
 
 
433 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0823  hypothetical protein  30.33 
 
 
1256 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0778  hypothetical protein  32.1 
 
 
340 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01520  conserved expressed protein  29.73 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36106  predicted protein  27.65 
 
 
827 aa  110  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46249  predicted protein  28.35 
 
 
831 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849514  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50635  predicted protein  28.61 
 
 
843 aa  106  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47597  predicted protein  27.13 
 
 
810 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36118  predicted protein  25.3 
 
 
880 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0289305  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47518  predicted protein  23.15 
 
 
953 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49115  predicted protein  22.99 
 
 
870 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00818275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>