21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0142 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0142  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  772    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3322  hypothetical protein  93.92 
 
 
378 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0156  hypothetical protein  92.89 
 
 
380 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2912  hypothetical protein  92.89 
 
 
380 aa  693    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0130  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  772    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0143  hypothetical protein  92.89 
 
 
380 aa  693    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0140  hypothetical protein  90.79 
 
 
380 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.705412 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3252  hypothetical protein  80.69 
 
 
372 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0130  hypothetical protein  85.59 
 
 
372 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3057  hypothetical protein  85.59 
 
 
372 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4001  hypothetical protein  85.59 
 
 
372 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3930  hypothetical protein  85.59 
 
 
372 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1545  hypothetical protein  85.59 
 
 
372 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3313  hypothetical protein  85.59 
 
 
372 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2992  hypothetical protein  85.59 
 
 
372 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3883  hypothetical protein  75.37 
 
 
376 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0053  hypothetical protein  74.78 
 
 
376 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3014  hypothetical protein  70.05 
 
 
378 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3163  hypothetical protein  51.33 
 
 
372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3266  hypothetical protein  22.69 
 
 
411 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.812163  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0304  hypothetical protein  28.16 
 
 
431 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0201932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>