43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50870 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_50870  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4337  hypothetical protein  91.92 
 
 		 99 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0544189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1222  hypothetical protein  48.48 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1123  hypothetical protein  46.74 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325982  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1159  hypothetical protein  46.74 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.32414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4293  hypothetical protein  46.24 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1144  hypothetical protein  43.48 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.626702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4783  hypothetical protein  48.15 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1424  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3861  hypothetical protein  41.98 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.928821  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4125  hypothetical protein  40.24 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4067  hypothetical protein  37.11 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54730  hypothetical protein  48.81 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000652647  hitchhiker  0.00000000388192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1370  hypothetical protein  44.12 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.744288  normal  0.112348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0091  hypothetical protein  37.97 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3879  hypothetical protein  37.63 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0097  hypothetical protein  36.71 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0219  hypothetical protein  32.14 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0366702 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0249  protein of unknown function DUF1145  32.91 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3665  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03315  conserved inner membrane protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03268  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4786  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3856  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3749  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0250  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3948  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3944  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0237  hypothetical protein  30.77 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0473211  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0575  hypothetical protein  30.77 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.970064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3981  hypothetical protein  30.77 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3775  hypothetical protein  30.38 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4096  protein of unknown function DUF1145  32.18 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3885  hypothetical protein  30.38 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.530428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3842  hypothetical protein  30.38 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4297  hypothetical protein  31.87 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.072852  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3870  hypothetical protein  28.92 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.324149  normal  0.172086 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.95222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3776  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3974  hypothetical protein  32.14 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3765  hypothetical protein  29.11 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4166  hypothetical protein  31.03 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784354  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0169  hypothetical protein  31.03 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>