16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1222 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1222  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1123  hypothetical protein  51.65 
 
 		 91 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325982  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1159  hypothetical protein  51.65 
 
 		 91 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.32414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4293  hypothetical protein  50.55 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1144  hypothetical protein  51.76 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.626702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4125  hypothetical protein  51.09 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3861  hypothetical protein  52.38 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.928821  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50870  hypothetical protein  48.48 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4337  hypothetical protein  53.01 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0544189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1424  hypothetical protein  41.77 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1370  hypothetical protein  44.12 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.744288  normal  0.112348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4783  hypothetical protein  36.25 
 
 		 81 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54730  hypothetical protein  37.04 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000652647  hitchhiker  0.00000000388192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0219  hypothetical protein  35.14 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0366702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3879  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0091  hypothetical protein  35.44 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>