12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4293 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4293  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1123  hypothetical protein  95.51 
 
 		 91 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325982  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1159  hypothetical protein  95.51 
 
 		 91 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.32414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1144  hypothetical protein  84.62 
 
 		 91 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.626702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1222  hypothetical protein  50.55 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4125  hypothetical protein  52.75 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3861  hypothetical protein  51.65 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.928821  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4337  hypothetical protein  47.31 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0544189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50870  hypothetical protein  46.24 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1424  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1370  hypothetical protein  32.05 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.744288  normal  0.112348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4783  hypothetical protein  32.5 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>