38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4337 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4337  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  194  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0544189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50870  hypothetical protein  91.92 
 
 		 99 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1222  hypothetical protein  53.01 
 
 		 92 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1123  hypothetical protein  47.83 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325982  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1159  hypothetical protein  47.83 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.32414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4293  hypothetical protein  47.31 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1144  hypothetical protein  45.12 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.626702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4783  hypothetical protein  46.91 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1424  hypothetical protein  40.48 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3861  hypothetical protein  41.98 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.928821  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4125  hypothetical protein  40.24 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4067  hypothetical protein  35.05 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54730  hypothetical protein  47.62 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000652647  hitchhiker  0.00000000388192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0091  hypothetical protein  37.97 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3879  hypothetical protein  35.79 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1370  hypothetical protein  43.28 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.744288  normal  0.112348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0097  hypothetical protein  36.71 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0219  hypothetical protein  32.14 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0366702 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0237  hypothetical protein  31.76 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0473211  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3981  hypothetical protein  31.76 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0575  hypothetical protein  31.76 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.970064  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0249  protein of unknown function DUF1145  32.91 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0250  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3749  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3948  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3856  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4786  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3665  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03268  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03315  conserved inner membrane protein  31.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3944  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3842  hypothetical protein  30.38 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3885  hypothetical protein  30.38 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.530428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3775  hypothetical protein  30.38 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3870  hypothetical protein  27.71 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.324149  normal  0.172086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4096  protein of unknown function DUF1145  30.77 
 
 		 94 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4297  hypothetical protein  30.77 
 
 		 91 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.072852  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0621  hypothetical protein  35.37 
 
 		 88 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>