40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3749 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03315  conserved inner membrane protein  100 
 
 		 89 aa  176  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3749  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3856  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03268  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3948  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4786  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3665  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0249  protein of unknown function DUF1145  98.88 
 
 		 89 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3775  hypothetical protein  87.64 
 
 		 89 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3885  hypothetical protein  87.64 
 
 		 89 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.530428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3842  hypothetical protein  87.64 
 
 		 89 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3944  hypothetical protein  87.64 
 
 		 89 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3765  hypothetical protein  86.52 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3870  hypothetical protein  69.32 
 
 		 93 aa  130  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.324149  normal  0.172086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0219  hypothetical protein  67.86 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0366702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0097  hypothetical protein  67.9 
 
 		 92 aa  116  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0091  hypothetical protein  66.67 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4067  hypothetical protein  65.85 
 
 		 95 aa  113  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3879  hypothetical protein  62.2 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0575  hypothetical protein  63.1 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.970064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3981  hypothetical protein  63.1 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0237  hypothetical protein  63.1 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0473211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0621  hypothetical protein  39.02 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3776  hypothetical protein  36.14 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3849  hypothetical protein  36.14 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.95222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3974  hypothetical protein  34.94 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4096  protein of unknown function DUF1145  34.09 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0287  hypothetical protein  32.14 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.122517  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4297  hypothetical protein  34.09 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.072852  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4166  hypothetical protein  34.09 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3982  hypothetical protein  30 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.263244  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002136  hypothetical protein  34.94 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00282  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4588  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0169  hypothetical protein  30.95 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2905  hypothetical protein  35.06 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0217  hypothetical protein  27.71 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2376  hypothetical protein  32.88 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.128305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0199  hypothetical protein  31.03 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000610654  decreased coverage  0.00000180775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>