37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4067 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4067  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  183  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3879  hypothetical protein  79.17 
 
 
96 aa  147  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0091  hypothetical protein  76.54 
 
 
92 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0097  hypothetical protein  76.54 
 
 
92 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3981  hypothetical protein  63.74 
 
 
90 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0575  hypothetical protein  63.74 
 
 
90 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.970064  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0237  hypothetical protein  63.74 
 
 
90 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0473211  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0249  protein of unknown function DUF1145  65.85 
 
 
89 aa  114  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03315  conserved inner membrane protein  65.85 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3856  hypothetical protein  65.85 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3749  hypothetical protein  65.85 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0250  hypothetical protein  65.85 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4786  hypothetical protein  65.85 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3948  hypothetical protein  65.85 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3665  hypothetical protein  65.85 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03268  hypothetical protein  65.85 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3870  hypothetical protein  60.47 
 
 
93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.324149  normal  0.172086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3842  hypothetical protein  65.85 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3885  hypothetical protein  65.85 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.530428  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3775  hypothetical protein  65.85 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0219  hypothetical protein  60.67 
 
 
90 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0366702 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3944  hypothetical protein  65.85 
 
 
89 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3765  hypothetical protein  64.63 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0621  hypothetical protein  38.37 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4096  protein of unknown function DUF1145  31.52 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4166  hypothetical protein  31.52 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784354  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2376  hypothetical protein  35.62 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.128305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00282  hypothetical protein  31.03 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002136  hypothetical protein  32.53 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4297  hypothetical protein  31.52 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.072852  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3974  hypothetical protein  32.56 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0287  hypothetical protein  32.56 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.122517  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2905  hypothetical protein  34.25 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50870  hypothetical protein  37.11 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000696577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4337  hypothetical protein  35.05 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0544189  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3849  hypothetical protein  32.26 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.95222  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3776  hypothetical protein  32.26 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>