38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3849 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3776  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3849  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.95222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3974  hypothetical protein  93.33 
 
 		 90 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4588  hypothetical protein  88.76 
 
 		 93 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4096  protein of unknown function DUF1145  75.82 
 
 		 94 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4297  hypothetical protein  75.82 
 
 		 91 aa  146  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.072852  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4166  hypothetical protein  74.73 
 
 		 94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0287  hypothetical protein  71.43 
 
 		 91 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.122517  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0169  hypothetical protein  75.82 
 
 		 94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0217  hypothetical protein  64.37 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3982  hypothetical protein  57.78 
 
 		 93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.263244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0199  hypothetical protein  56.67 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000610654  decreased coverage  0.00000180775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3470  hypothetical protein  58.43 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367441  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3608  hypothetical protein  53.33 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0621  hypothetical protein  35.23 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2376  hypothetical protein  34.12 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.128305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002136  hypothetical protein  34.12 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0249  protein of unknown function DUF1145  37.35 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3870  hypothetical protein  36.67 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.324149  normal  0.172086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03315  conserved inner membrane protein  36.14 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3665  hypothetical protein  36.14 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03268  hypothetical protein  36.14 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0250  hypothetical protein  36.14 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3749  hypothetical protein  36.14 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3856  hypothetical protein  36.14 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4786  hypothetical protein  36.14 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3948  hypothetical protein  36.14 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3765  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2905  hypothetical protein  34.12 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3775  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3885  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.530428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3842  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3944  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00282  hypothetical protein  30.59 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0219  hypothetical protein  29.27 
 
 		 90 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0366702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4067  hypothetical protein  32.26 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0097  hypothetical protein  32.5 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0091  hypothetical protein  32.5 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>