21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3608 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3608  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  191  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0217  hypothetical protein  56.18 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3974  hypothetical protein  54.44 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3776  hypothetical protein  53.33 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3849  hypothetical protein  53.33 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.95222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0287  hypothetical protein  51.11 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.122517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4588  hypothetical protein  53.93 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4166  hypothetical protein  51.11 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784354  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4096  protein of unknown function DUF1145  51.11 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4297  hypothetical protein  51.11 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.072852  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3982  hypothetical protein  47.92 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.263244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0169  hypothetical protein  51.11 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0199  hypothetical protein  52.22 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000610654  decreased coverage  0.00000180775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3470  hypothetical protein  56.63 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367441  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002136  hypothetical protein  32.18 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2905  hypothetical protein  33.71 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2376  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.128305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00282  hypothetical protein  29.89 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0621  hypothetical protein  33.72 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0219  hypothetical protein  28.92 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0366702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3765  hypothetical protein  29.07 
 
 		 89 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>