34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4588 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4588  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  186  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3974  hypothetical protein  93.26 
 
 		 90 aa  166  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3776  hypothetical protein  88.76 
 
 		 91 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3849  hypothetical protein  88.76 
 
 		 91 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.95222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4096  protein of unknown function DUF1145  78.65 
 
 		 94 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4297  hypothetical protein  80.46 
 
 		 91 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.072852  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0287  hypothetical protein  77.53 
 
 		 91 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.122517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4166  hypothetical protein  77.53 
 
 		 94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784354  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0169  hypothetical protein  76.92 
 
 		 94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0217  hypothetical protein  61.29 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3982  hypothetical protein  55.91 
 
 		 93 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.263244  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3470  hypothetical protein  58.06 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367441  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0199  hypothetical protein  53.93 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000610654  decreased coverage  0.00000180775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3608  hypothetical protein  53.93 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2376  hypothetical protein  34.12 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.128305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002136  hypothetical protein  35.29 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3870  hypothetical protein  35.48 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.324149  normal  0.172086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0621  hypothetical protein  33.72 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00282  hypothetical protein  31.76 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0249  protein of unknown function DUF1145  33.33 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2905  hypothetical protein  34.12 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3665  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03315  conserved inner membrane protein  33.33 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4786  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3749  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0250  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3948  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3885  hypothetical protein  30.95 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.530428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3765  hypothetical protein  30.95 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3775  hypothetical protein  30.95 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3842  hypothetical protein  30.95 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3944  hypothetical protein  30.95 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>