11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1370 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1370  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.744288  normal  0.112348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54730  hypothetical protein  53.16 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000652647  hitchhiker  0.00000000388192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4783  hypothetical protein  52.56 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1222  hypothetical protein  44.12 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1144  hypothetical protein  35.9 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.626702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1123  hypothetical protein  32.05 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325982  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1159  hypothetical protein  32.05 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.32414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4293  hypothetical protein  32.05 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0219  hypothetical protein  34.38 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0366702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50870  hypothetical protein  44.12 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4125  hypothetical protein  38.81 
 
 		 91 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>