11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1123 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1123  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325982  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1159  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.32414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4293  hypothetical protein  95.51 
 
 		 91 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1144  hypothetical protein  85.39 
 
 		 91 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.626702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1222  hypothetical protein  51.65 
 
 		 92 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3861  hypothetical protein  55.95 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.928821  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4125  hypothetical protein  55.95 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4337  hypothetical protein  47.83 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0544189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50870  hypothetical protein  48.78 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1424  hypothetical protein  41.67 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1370  hypothetical protein  32.05 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.744288  normal  0.112348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>