11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1424 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1424  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  257  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4293  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1144  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.626702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1123  hypothetical protein  43.21 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325982  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1159  hypothetical protein  43.21 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.32414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1222  hypothetical protein  38.24 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50870  hypothetical protein  39 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4337  hypothetical protein  37.62 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0544189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4125  hypothetical protein  39.29 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3861  hypothetical protein  39.56 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.928821  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4783  hypothetical protein  42.42 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>