13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3861 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3861  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.928821  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4125  hypothetical protein  86.81 
 
 		 91 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1222  hypothetical protein  52.38 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1123  hypothetical protein  55.95 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325982  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1159  hypothetical protein  55.95 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.32414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4293  hypothetical protein  51.65 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1144  hypothetical protein  54.22 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.626702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1424  hypothetical protein  43.24 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4337  hypothetical protein  41.98 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0544189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50870  hypothetical protein  41.98 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4783  hypothetical protein  38.82 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1370  hypothetical protein  38.81 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.744288  normal  0.112348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54730  hypothetical protein  38.82 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000652647  hitchhiker  0.00000000388192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>