11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54730 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54730  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  153  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000652647  hitchhiker  0.00000000388192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4783  hypothetical protein  96.3 
 
 		 81 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1370  hypothetical protein  53.16 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.744288  normal  0.112348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1222  hypothetical protein  37.04 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50870  hypothetical protein  48.81 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4337  hypothetical protein  47.62 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0544189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1424  hypothetical protein  43.48 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3861  hypothetical protein  38.82 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.928821  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1144  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.626702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4293  hypothetical protein  32.1 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4125  hypothetical protein  38.57 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>