19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4125 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4125  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  180  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3861  hypothetical protein  86.81 
 
 		 91 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.928821  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1222  hypothetical protein  51.09 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4293  hypothetical protein  52.75 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1144  hypothetical protein  54.12 
 
 		 91 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.626702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1123  hypothetical protein  55.95 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325982  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1159  hypothetical protein  55.95 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.32414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1424  hypothetical protein  41.56 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4337  hypothetical protein  40.24 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0544189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50870  hypothetical protein  40.24 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1370  hypothetical protein  38.81 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.744288  normal  0.112348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4783  hypothetical protein  36.14 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54730  hypothetical protein  35.71 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000652647  hitchhiker  0.00000000388192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0091  hypothetical protein  32.89 
 
 		 92 aa  42.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0097  hypothetical protein  31.58 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0237  hypothetical protein  29.76 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0473211  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0575  hypothetical protein  29.76 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.970064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3981  hypothetical protein  29.76 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3879  hypothetical protein  28.57 
 
 		 96 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>