250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3081 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3081  arsenate reductase and related  100 
 
 
118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20470  glutaredoxin family protein, arsenate reductase  58.47 
 
 
118 aa  140  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4508  arsenate reductase and related  60.17 
 
 
121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0745404  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1521  glutaredoxin family protein  55.56 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0272827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2640  arsenate reductase and related  55.37 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00790249  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3022  arsenate reductase-like protein  55.46 
 
 
117 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2790  putative arsenate reductase  49.11 
 
 
115 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  36.84 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0846  arsenate reductase  45.63 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  normal  0.401181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  35.96 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1588  arsenate reductase (glutaredoxin)  37.5 
 
 
112 aa  76.6  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.686638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  35.96 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  36.84 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  34.82 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  35.96 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0914  arsenate reductase  37.72 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  34.21 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  32.14 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  34.21 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09213  probable arsenate reductase (glutaredoxin)  30.83 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.641437  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  35.78 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  31.58 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  31.25 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  33.93 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  30.36 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  34.86 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  30.36 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2887  arsenate reductase  42.42 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.514096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3564  arsenate reductase  42.42 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  30.36 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  41.84 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  30.36 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  33.93 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  30.7 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0826  arsenate reductase  37.39 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295168  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  33.63 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  33.04 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  38.78 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4964  arsenate reductase  35.59 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000180468  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  31.58 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  35.48 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3103  arsenate reductase  34.75 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000012138  normal  0.181739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  32.14 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1542  arsenate reductase  34.82 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  34.75 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  29.82 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  34.75 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5167  arsenate reductase  34.75 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000109788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5692  arsenate reductase  34.75 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000484398  hitchhiker  0.00107308 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  34.75 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1207  arsenate reductase  29.2 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0485928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  30.7 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4544  arsenate reductase  34.75 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001485  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  32.14 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3935  arsenate reductase  33.67 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110005  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  31.25 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  31.25 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2339  arsenate reductase  27.78 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0346722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  31.25 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  30.97 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3418  arsenate reductase  34.69 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  39.39 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  31.86 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  29.46 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  37 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  37 
 
 
317 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1073  arsenate reductase  29.57 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0830034  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4174  arsenate reductase  39 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181376  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  31 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  30.09 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  30.36 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3865  arsenate reductase  39 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  30.7 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  30.09 
 
 
118 aa  60.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2113  arsenate reductase  33.9 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0142816  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  32.17 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  32.17 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  32.17 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  32.17 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2408  arsenate reductase  33.9 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00110254  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1142  arsenate reductase  33.9 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023694  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1421  arsenate reductase  33.9 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245055  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  32.17 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  31.86 
 
 
116 aa  60.1  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3279  arsenate reductase  38.14 
 
 
113 aa  60.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2385  putative arsenate reductase  28.32 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3271  putative arsenate reductase oxidoreductase protein  35.09 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1852  arsenate reductase  32.46 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  29.2 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2964  arsenate reductase  33.33 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0847246  normal  0.0110665 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  32.46 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  27.45 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  29.2 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  29.2 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4629  arsenate reductase  33.04 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12717  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4250  arsenate reductase  33.04 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02143  putative arsenate reductase ArsC  30.09 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0470419  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  32.41 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4336  arsenate reductase  33.04 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0780089  normal  0.281607 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  34.69 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>