260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20470 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_20470  glutaredoxin family protein, arsenate reductase  100 
 
 
118 aa  237  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1521  glutaredoxin family protein  67.24 
 
 
145 aa  157  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0272827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4508  arsenate reductase and related  65.25 
 
 
121 aa  156  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0745404  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2640  arsenate reductase and related  64.1 
 
 
121 aa  156  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00790249  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3081  arsenate reductase and related  58.47 
 
 
118 aa  140  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2790  putative arsenate reductase  50.43 
 
 
115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3022  arsenate reductase-like protein  52.99 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2339  arsenate reductase  42.34 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0346722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  45.3 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  46.15 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  44.07 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  44.44 
 
 
117 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  45.3 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  44.25 
 
 
117 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  43.59 
 
 
117 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  43.1 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  44.64 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  42.24 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  39.13 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0846  arsenate reductase  42.61 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  normal  0.401181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  41.03 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1588  arsenate reductase (glutaredoxin)  37.07 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.686638  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  40.17 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  39.66 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  39.32 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1073  arsenate reductase  37.29 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0830034  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3103  arsenate reductase  42.5 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000012138  normal  0.181739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  39.13 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  39.13 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4964  arsenate reductase  41.67 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000180468  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  39.13 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  39.13 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  39.32 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  37.39 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  39.13 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  36.52 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2883  arsenate reductase  41.23 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  36.52 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  38.46 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  38.26 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  37.93 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  36.52 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  36.75 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09213  probable arsenate reductase (glutaredoxin)  31.67 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.641437  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  36.75 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  36.75 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4544  arsenate reductase  39.17 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001485  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  38.26 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  37.93 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  38.33 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  37.61 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  38.33 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1207  arsenate reductase  34.78 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0485928  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3141  arsenate reductase  38.84 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  38.33 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0914  arsenate reductase  39.13 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  36.21 
 
 
116 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2964  arsenate reductase  36.75 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0847246  normal  0.0110665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  36.52 
 
 
116 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  34.19 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  39.13 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5167  arsenate reductase  37.5 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000109788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5692  arsenate reductase  37.5 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000484398  hitchhiker  0.00107308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3935  arsenate reductase  34.78 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110005  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  32.76 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1881  arsenate reductase  37.07 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0302  hypothetical protein  38.74 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2370  arsenate reductase  37.5 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000151133  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3163  arsenate reductase  42.37 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000451788  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  37.39 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3271  putative arsenate reductase oxidoreductase protein  39.02 
 
 
134 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  36.21 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4150  arsenate reductase  36.89 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572754  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0318  hypothetical protein  37.84 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  37.07 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  36.44 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3469  arsenate reductase and related  37.7 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  36.44 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  36.44 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2113  arsenate reductase  37.5 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0142816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2408  arsenate reductase  37.5 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00110254  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3030  arsenate reductase  36.07 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26931  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7012  arsenate reductase  39.13 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132102  hitchhiker  0.00599586 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  36.44 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2484  arsenate reductase  36.59 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1421  arsenate reductase  37.5 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245055  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  36.44 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0826  arsenate reductase  36.13 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295168  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1142  arsenate reductase  37.5 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  36.52 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4257  arsenate reductase  35.65 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.339282 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  37.07 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  36.52 
 
 
116 aa  67  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1157  arsenate reductase and related  36.21 
 
 
121 aa  67  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.994579  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  37.61 
 
 
116 aa  67  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  35.34 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  33.62 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  34.78 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  34.78 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2168  arsenate reductase  34.78 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>