217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2640 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2640  arsenate reductase and related  100 
 
 
121 aa  243  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00790249  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20470  glutaredoxin family protein, arsenate reductase  64.1 
 
 
118 aa  156  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4508  arsenate reductase and related  68.07 
 
 
121 aa  155  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0745404  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1521  glutaredoxin family protein  62.93 
 
 
145 aa  148  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0272827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3081  arsenate reductase and related  55.37 
 
 
118 aa  126  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2790  putative arsenate reductase  52.17 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3022  arsenate reductase-like protein  51.28 
 
 
117 aa  110  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669385  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1588  arsenate reductase (glutaredoxin)  35.65 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.686638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  39.83 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  40.52 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  38.14 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  38.14 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  37.39 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  38.46 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  37.29 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  37.39 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  40.18 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2339  arsenate reductase  35.14 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0346722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  35.65 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  40.18 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  37.39 
 
 
118 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  36.52 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0846  arsenate reductase  37.39 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  normal  0.401181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  35.65 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  33.91 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2964  arsenate reductase  35.04 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0847246  normal  0.0110665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3935  arsenate reductase  35.65 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110005  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  35.59 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  35.65 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  33.04 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  35.65 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  35.65 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0302  hypothetical protein  37.84 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  36.75 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  33.9 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09213  probable arsenate reductase (glutaredoxin)  27.83 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.641437  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  33.91 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  36.52 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0914  arsenate reductase  35.65 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  36.19 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  33.9 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  30.77 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1881  arsenate reductase  31.3 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0318  hypothetical protein  36.94 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  34.78 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4250  arsenate reductase  37.39 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4336  arsenate reductase  37.39 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0780089  normal  0.281607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4629  arsenate reductase  37.39 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12717  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  33.9 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  36.75 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  35.34 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  33.91 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  35.34 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  33.62 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  34.75 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  34.75 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  34.75 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  33.62 
 
 
317 aa  60.5  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1181  arsenate reductase  33.62 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  32.17 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  33.33 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  32.17 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2883  arsenate reductase  35.96 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0826  arsenate reductase  33.9 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295168  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  32.17 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  32.17 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  35.65 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  35.65 
 
 
113 aa  58.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4784  arsenate reductase  33.33 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3141  arsenate reductase  31.4 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1542  arsenate reductase  32.67 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2539  arsenate reductase  35.04 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.220394  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  34.19 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  34.78 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  32.48 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4784  arsenate reductase  33.91 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.375449  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  33.05 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4150  arsenate reductase  31.09 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572754  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0718  arsenate reductase  31.9 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0377236 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1977  arsenate reductase  33.62 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224843  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1073  arsenate reductase  28.81 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0830034  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3103  arsenate reductase  33.05 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000012138  normal  0.181739 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  29.41 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1048  arsenate reductase  31.9 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2113  arsenate reductase  33.9 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0142816  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3199  arsenate reductase  33.62 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  34.48 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  33.62 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  30.17 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  30.17 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2887  arsenate reductase  34.19 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.514096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  34.48 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1142  arsenate reductase  33.9 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023694  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1421  arsenate reductase  33.9 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245055  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2408  arsenate reductase  33.9 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00110254  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  33.04 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  32.48 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4257  arsenate reductase  29.31 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.339282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4662  arsenate reductase  34.15 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246432  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  33.9 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>